据传统医学理论，薏米具有清热利湿、健脾化湿的功效，能够改善痘痘和过敏皮肤等问题。而扁平疣则是一种常见的皮肤病，病因多因病毒感染或免疫系统问题引起。因此，薏米水是否可以治疗扁平疣并没有科学证据。
如果你想要尝试使用薏米水治疗扁平疣，建议先咨询专业医生的意见。同时，改善饮食习惯和生活习惯、增强体质、保持心情舒畅也能对免疫系统产生帮助，起到辅助治疗的作用。