黑苦荞茶全株和全胚的区别在于：
1. 全株茶：是以整株茶叶为原料制成的茶叶。即将黑苦荞茶的茶枝、叶子等一起制成的茶叶，包括茶叶的扁平部分和茎部分，具有独特的口感和风味。
2. 全胚茶：是以黑苦荞茶的蕊和胚芽为原料制成的茶叶。在制茶过程中，只取黑苦荞茶的茶芽和嫩叶，去除了茶枝和老叶，制成的茶叶叫全胚茶。与全株茶相比，全胚茶更嫩滑，味道更清香。
总体而言，全株茶和全胚茶的制作工艺和口感有差异，而全胚茶相对更加嫩滑清香。